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| 一站式掌握gromacs建模 |
| GROMACS与AMBER软件安装以及初始结构搭建的常用方法 |
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课程内容
第一节GROMACS与AMBER软件安装以及初始结构搭建的常用方法
-----常用力场简介，常用体系的模型搭建
第二节有机体系、膜蛋白体系的模型和拓扑结构搭建
------使用在线工具创建OPLS-AA，charmm27力场文件
第三节生物蛋白体系模型和拓扑结构搭建
------以AMBER力场为例讲解非标准残基的处理
第四节特殊体系的模型和拓扑结构搭建
------使用GAFF力场为dendrimer聚合物建模
讲师介绍
许博士，浙江大学化工学院在读博士，从事分子模拟和量化研究，多年Python使用经验，熟悉c/c++, fortran, bash, javascript等编程语言，目前是VASP后处理软件VASPKIT的合作开发者之一，并开发了大量自用脚本。
2019年签约成为材料人计算科技顾问。
上课时间
共计时长5个小时
第一二节课2019年6月30日14：00-16：30
退货说明
因虚拟产品特殊性，课程一经购买不提供退课服务，请谨慎购买。
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GROMACS与AMBER软件安装以及初始结构搭建的常用方法
一站式掌握gromacs建模
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有机体系、膜蛋白体系的模型和拓扑结构搭建
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生物蛋白体系模型和拓扑结构搭建
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特殊体系的模型和拓扑结构搭建
一站式掌握gromacs建模
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| 喜欢행운. (2025-08-22) | 回复TA |
非标准PDB文件转换网站打不开
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计算科技顾问许老师 (2020-07-15) | 回复TA |
有
| IM (2020-05-18) | 回复TA |
有介绍如何建立GAFF通用力场吗
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