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| LAMMPS-GROMACS联用分析动力学性质 |
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研讨会内容
LAMMPS-GROMACS联用分析动力学性质 以计算0.5 mol/L KCl水溶液扩散系数为例。
专题研讨时间
2020.07.16 18:00-20:30
讲师介绍
许博士，浙江大学化工学院在读博士，从事分子模拟和量化研究，多年Python使用经验，熟悉c/c++, fortran, bash, javascript等编程语言，目前是VASP后处理软件VASPKIT的合作开发者之一，并开发了大量自用脚本。
2019年签约成为材料人计算科技顾问。
| 王瑞 (2020-07-23) | 回复TA |
许老师，请问data2gmx脚本文件在哪里可以下载？
计算科技顾问许老师回复：
https://github.com/tamaswells/ (2020-08-01)
| 简简单单 (2020-07-16) | 回复TA |
许老师，请问后面会出系列课程吗，对于我这种小白来讲，确实一时消化不了
计算科技顾问许老师回复：
很有可能是像今天这样的公开课的形式 没有精力做系列课程了 (2020-07-16)
| 闲云野鹤 (2020-07-16) | 回复TA |
机器学习势可以用于溶液反应吗?
计算科技顾问许老师回复：
试试ANI (2020-07-16)
| 闲云野鹤 (2020-07-16) | 回复TA |
lammps算溶液的可不可以设个某种力场就不用设势函数参数了
| 王瑞 (2020-07-16) | 回复TA |
许老师，请问怎么利用lammps计算氢键的时间自相关函数
计算科技顾问许老师回复：
不是均匀体系 没必要回归到1 (2020-07-16)
计算科技顾问许老师回复：
我刚用vmd看了一下 cutoff时rdf就已经衰减成0了
(2020-07-16)
王瑞回复：
构建了液体和固体的界面模型，Rdf约为1.5 (2020-07-16)
王瑞回复：
如果RDF不趋近于1，是什么原因造成的呢？ (2020-07-16)
王瑞回复：
这个无穷远是怎么定义的？一般求RDF时，选择的范围多大？是simulation cell 的一半吗？ (2020-07-16)
王瑞回复：
请问下原子的RDF最后一定是趋近于1吗？或者是趋近于一个定值 (2020-07-16)
王瑞回复：
因为MD analysis是Python编写的，需要在Windows上安装Python才能使用吗？ (2020-07-16)
| adong (2020-07-16) | 回复TA |
老师，针对这种溶液体系，lammps和gromacs那个效率更高？您训练的神经网络势方便用在gromacs中吗？
计算科技顾问许老师回复：
有力场首选gromacs (2020-07-16)
| 简简单单 (2020-07-16) | 回复TA |
老师，您写各种文件用的什么软件啊
计算科技顾问许老师回复：
http://muchong.com/t-10969479-1-pid-5 (2020-07-16)
| adong (2020-07-16) | 回复TA |
请问有回放吗？网不好，好卡
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