VMD软件分为两节：基本篇、进阶篇

基本篇

1、显示原子结构，调整显示方式
2、选择特定区域的原子
3、对比两个原子结构
4、测量键长、键角等空间位置
5、结构分析（例如径向分布函数）

进阶篇
1、制作原子动态动画，videomech
2、原子结构渲染
3、tcl脚本
4、其他功能的简单介绍