清华大学生命学院李雪明副教授课题组在《自然·通讯》（Nature Communications）在线发表题为“MPicker：冷冻电子断层成像中膜蛋白的可视化与挑选”（MPicker:visualizing and picking membrane proteins for cryo-electron tomography）的研究论文。研究团队开发了名为MPicker的新软件，该软件能够在多种细胞切片样品的tomogram中清晰展示膜表面的蛋白分布。在展平tomogram中，用户可以更方便地识别并挑选颗粒。为了提高自动化程度，MPicker还整合了EPicker软件（一款原本用于单颗粒图像的自动颗粒挑选工具），充分利用了展平tomogram二维化的优势。除了在MPicker中进行操作，用户也可以灵活地使用其他软件在展平tomogram中进行颗粒挑选。MPicker还可以提供每个颗粒的初始取向用于辅助膜蛋白STA的计算。除了常规的膜法向量，用户还可以方便地通过MPicker在展平tomogram中标注蛋白在膜表面的面内取向，从而利用更强的角度约束来辅助STA的计算。为提高取向确定的自动化程度，研究团队将膜蛋白沿膜法向量投影，并进行了改造的二维分类，从而更高效地获得每个颗粒的精准取向信息。通过这一方法，团队使用四套tomogram数据成功解析了衣藻PSII-LHCII超复合物的低分辨原位结构，并将结果上传至EMDB数据库（EMD-61019）。