利用gromacs进行材料模拟基础课

1.2 gromacs模拟基本流程

课程内容

1  GROMACS入门操作基础
1.1掌握GROMACS所用的Linux命令
1.2 GROMACS的linux版编译安装
1.3 GROMACS各种输入输出文件讲解
1.4 GROMACS力场讲解
2 GROMACS建模
2.1 Packmol，GaussView，vmd等建模软件、分析工具的使用
2.2各种分子力场的构建
2.3周期性无机晶体材料的模型构建（表面修饰二氧化硅晶体为例）
3 实例讲解
3.1 含碳纳米管体系的构建以及模拟
3.2 金属的拉伸动力学模拟（材料拉伸、摩擦和剪切）
3.3气液界面、固液界面、固固界面和气固界面的模拟

 

培训讲师

刘老师，博士毕业，拥有多年线下讲授gromacs的经验，2018年底成为材料人计算科技顾问。

1.1 分子动力学假设与势函数 利用gromacs进行材料模拟基础课

1.2 gromacs模拟基本流程 利用gromacs进行材料模拟基础课

1.3 gromacs三大输入文件 利用gromacs进行材料模拟基础课

1.4 gromacs答疑 利用gromacs进行材料模拟基础课

2.1 gromacs力场介绍 利用gromacs进行材料模拟基础课

2.2 gromacs常用linux命令 利用gromacs进行材料模拟基础课

2.3PDB文件建立 利用gromacs进行材料模拟基础课

2.4TOP文件搭建 利用gromacs进行材料模拟基础课

3.1碳纳米管模拟与搭建 利用gromacs进行材料模拟基础课

3.2 修饰二氧化硅晶体模型搭建 利用gromacs进行材料模拟基础课

3.3气液界面表面活性剂模拟 利用gromacs进行材料模拟基础课

3.4 金属拉伸动力学模拟 利用gromacs进行材料模拟基础课