课程内容

1.VASP轨迹提取与系综稳定性(采用XDATCAR_toolkit.py工具) 
2.关联函数以及其在分子动力学结果分析中的应用
2.1介绍:直观的定性的介绍在时间和空间中的相关性的定义
Velocity-velocity correlation function
原子运动的相关随着模拟时间的衰减
计算振动谱(速度自相关函数的傅里叶变换)
计算扩散系数（Green-Kubo relation计算扩散系数）
2.3.Pair correlation function (density-density correlation)
分析有序/无序结构
计算平均配位数等
与实验数据进行比较
2.4.Time correlation function (density-density correlation)
时间关联函数计算平均寿命
平均寿命的拟合方法的选取
2.5.均方根位移以及扩散系数的计算
2.6.后处理分析软件的推荐以及脚本的编写使用（MDAnalysis；MD_Traj）

授课老师

余博士，浙江大学化工学院在读博士，从事分子模拟和量化研究，多年Python使用经验，熟悉c/c++, fortran,等编程语言。