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课程内容

第一节GROMACS与AMBER软件安装以及初始结构搭建的常用方法

-----常用力场简介,常用体系的模型搭建

第二节有机体系、膜蛋白体系的模型和拓扑结构搭建

------使用在线工具创建OPLS-AA,charmm27力场文件

第三节生物蛋白体系模型和拓扑结构搭建

------以AMBER力场为例讲解非标准残基的处理

第四节特殊体系的模型和拓扑结构搭建

------使用GAFF力场为dendrimer聚合物建模

 

讲师介绍

许博士,浙江大学化工学院在读博士,从事分子模拟和量化研究,多年Python使用经验,熟悉c/c++, fortran, bash, javascript等编程语言,目前是VASP后处理软件VASPKIT的合作开发者之一,并开发了大量自用脚本。

2019年签约成为材料人计算科技顾问。

 

上课时间

共计时长5个小时

第一二节课2019年6月30日14:00-16:30

 

退货说明

因虚拟产品特殊性,课程一经购买不提供退课服务,请谨慎购买。