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lammps三日入门到进阶
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介绍 目录 留言  

课程表

第一天上午(9:00-12:00)

1. 分子动力学简介

1.1跨尺度视角下的分子动力学模拟

  1.1.1 第一性原理、分子动力学

  1.1.2 相场模拟、有限元

1.2分子动力学模拟的优势和局限

  1.2.1 微观尺度的原子级别机理

  1.2.2 模拟尺度的局限性

1.3分子动力学模拟的理论基础

  1.3.1 边界条件

  1.3.2 时间积分算法

  1.3.3 热力学系综

  1.3.4 势函数(对势,多体势,力场势等)

1.4分子动力学常用软件介绍

  1.4.1 GROMACS、LAMMPS、Amber、DL-POLY等

  1.4.2 为什么选择LAMMPS?

2. LAMMPS软件简介

2.1 LAMMPS运行的几个重要文件

(.in文件,.eam势函数文件,.data结构文件)

2.2 一个简单的金属拉伸运行实例演示

2.3 in文件(核心运行文件)及其结构讲解

2.4 常用命令详解(fix, compute, boundary等)

2.5 势函数文件设置及其选择原则

2.5.1 势函数文件设置的注意事项

2.5.2 势函数文件的测试方法

第一天下午(14:30-17:30)

3. LAMMPS软件进阶

3.1 in文件命令设置、调试和注意事项

3.2 data结构文件及其构建方法

3.3 MEAM势函数和REAXFF反应势函数简介

第二天上午(9:00-12:00)

4. LAMMPS超算运行及数据处理

4.1 Windows/Linux系统下的LAMMPS运行

4.2 数据可视化及后处理(OVITO,VMD等)

4.3 数据提取及分析(自编程序处理数据)

第二天下午(14:30-17:30)

5. LAMMPS实例操作

5.1金属材料力学加载模拟:拉伸/压缩/剪切/扭转等

5.1.1 几种常用的力学加载方式设置

5.1.2 加载方式选择的注意事项和命令配合

5.2纳米压痕下的金属材料塑性演变(位错提取、分析)

5.2.1 纳米压痕实验的设置方式

5.2.1 纳米压痕实验的力-位移以及微观结构数据提取

5.3水/石墨烯杂化势函数模拟(不同类型势函数的耦合使用)

第三天上午(9:00-12:00)

6.  LAMMPS实例操作(进阶)

6.1高熵合金模拟及成分调控

6.1.1高熵合金的数据结构建模

6.1.2 MEAM势函数的使用

6.1.3多晶高熵合金模型的构建

6.2基于第一性原理的磷烯力场构建及分子动力学应用

6.2.1 结合VASP计算分子力场参数

6.2.2力场势函数文件的调试

6.2.3 LAMMPS应用自定义力场势函数计算磷烯/水分子超运输实例

第三天下午(14:30-17:30)

6.3 REAXFF反应势函数研究Li/Si锂离子电池界面扩散

6.3.1 REAXFF反应势函数详解

6.3.2反应势函数使用的注意事项

6.3.3反应势函数计算Li/Si界面反应实例计算

6.3.4 REAXFF反应模拟计算的数据处

 

授课时间

2022年9月17日、18日、25日 9:00-12:00; 14:00-17:00

 

授课老师

周老师,博士毕业于国内985高校,高校青年教师。自博士阶段起长期从事分子动力学模拟相关方面研究,擅长于利用分子动力学方法解决微观实验表征无法理解和解决的微观物理、化学机理,基于LAMMPS分子动力学软件模拟发表SCI论文9篇,参与多项国家级自然科学基金项目,主持多项省级自然科学项目。