下图为三种常用的模型构建策略路线图I、II、III。

通常情况下路线I能完成许多基本的模型构建和导出，当遇到一些较复杂的模型需要组装时就会显得力不从心了。如下图这种，多组分固液模型组装。

此时，我们需要利用到组装工具软件Packmol，按照路线II完成组装和转化。

1. 在MS中构建好所需要的所有组分结构，导出为.pdb文件。

需要注意的是，导出前需要手动设置每个原子的Name，相同原子类型的设置为相同Name，不同原子类型需要设置为不同Name，此处设置为该路线中的关键步骤。

1. 编写用于Packmol组装的in文件，利用packmol.exe可执行程序完成组装,得到组装完成结构文件structure_Gra_Al2SO4_3-0.6M.pdb。

# 距离容差, 不同分子中原子间的最小距离2A
tolerance 2.0
# 输入输出文件的格式
filetype pdb
# 输出文件的名字
output structure_Gra_Al2SO4_3-0.6M.pdb
#
structure Gra.pdb
  number 1
  center
  fixed 19.0179 18.45 30.01 0. 0. 0.
end structure
#
structure H2O.pdb
  number 2840
  inside box 1.0 1.0 1.0 37.5 37.0 59.0
end structure
#
structure Al.pdb
  number 60
  inside box 1.0 1.0 1.0 37.5 37.0 59.0
end structure
#
structure SO4.pdb
  number 90
  inside box 1.0 1.0 1.0 37.5 37.0 59.0
end structure

1. 将组装完成结构文件structure_Gra_Al2SO4_3-0.6M.pdb重新拖回到MS中。任意选中一个原子，可以发现原子属性中Name栏为预设原子Name，而ForcefiledType力场类型栏为空。

此时我们借助name2ffield.pl脚本将结构中所有原子Name属性复制到ForcefiledType属性。

name2ffield.pl文件内容如下

#!perl
use strict;
use Getopt::Long;
use MaterialsScript qw(:all);

my $doc = $Documents{"structure_Gra_Al2SO4_3-0.6M.xsd"};
my $atoms = $doc->Atoms;

foreach my $atom (@$atoms) {
    $atom->ForcefieldType = $atom->Name;
}

name2ffield.pl脚本执行完，可以随意选择其中几个原子检查ForcefiledType力场类型设置是否正确完成。

1. ForcefiledType力场类型设置完成后，在MS中添加晶格。

晶格添加完成后模型

1. 导出为为.car文件格式，然后利用msi2lmp.exe小程序来完成格式的转换，即可生成需要的data文件structure_Gra_Al2SO4_3-0.6M.data。重复路线I中对应检查。使用Ovito软件查看data文件，可得如下所示结构。

附件：本案例中对应结构文件

20180125-Graphene-Al2SO43-K2SO4.7z