在Lammps分子动力学模拟计算中，首先要做的就是构建计算模型，而构建计算模型通常有两种方法

1.     1. 借助外部建模软件。如常见的Material Studio、Packmol等外部建模工具，其优点是可见度高，所见即所得，并且方便原子建模时的微操。

2.     2. 使用Lammps自带命令。如lattice、 region、group、create_atoms、delete_atoms等命令，通过巧妙的组合这些命令，能实现外部建模不方便或不能实现的操作。

        通过上述两种方法的有机组合，可以实现非常多有趣或复杂的模型的构建。今天将主要介绍几个巧妙应用自带命令组合建模的案例。

• 构建矩形纳米通道模型

  
  

              目标模型：具有矩形通道纳米孔

• 建模命令：见附件

• 构建圆形纳米通道模型

              目标模型：具有圆形通道纳米孔

• 建模命令：见附件

• 构建三角形纳米通道模型

              目标模型：具有三角形通道纳米孔

• 建模命令：见附件

• 上述三个案例in文件

• 20210116-dig-data-with-hole.7

• 课后案例实践

• 通过调整建模命令中参数，如 replicate倍数，矩形 、圆形、三角形位置参数。得到不同大小或形状的通道模型

• 通过region组合，尝试得到半圆半矩形的纳米通道模型